Aún no miré demasiado las cosas de los castigos, pero viendo el cambio gordísimo en el paladín, lo normal sería que todos los castigos de ese estilo funcionaran igual.

En principio no habría problema por utilizar el manual de 3.5 mientras no se domina todo el reglamento de Pathfinder. Hay cosas incompatibles, otras tienen cambios más o menos grandes, pero en realidad podrías usar casi todo el material anterior.

Las reglas de combate son muy parecidas, aunque ha cambiado la forma de hacer maniobras de desarme, derribo y todo eso.

Las habilidades han cambiado bastante. Algunas se han eliminado y en general dan la impresión de tener más utilidades.

Las clases han cambiado bastante. Dan ganas de jugar con clases básicas sin meterte rápidamente en clases de prestigio.

Los conjuros tengo entendido que han perdido potencia en muchos casos, habría que verlo conjuro por conjuro.

Si quieres saber algo más concreto, pregunta. Seguro que te puede responder alguien.

P.D. ¿Tan mala fue la experiencia de la 4ª edición?

Uhm... esa es una gran pregunta. Se supone que el sistema de Pathfinder está hecho para que haya la máxima compatibilidad con material anterior.

Puede que te interese echarle un vistazo al "Pathfinder conversion guide". Es una descarga gratuita (sólo hay que registrarse en la web de Paizo) y aunque todavía no lo leí en profundidad, supongo que puede aclarar muchas de las dudas sobre compatibilidad.

A pesar de eso, seguramente con adaptaciones más o menos chapuceras sobre la marcha seguro que casi todo se podría utilizar.

Otra area que ha cambiado de manera mas notoria son las habilidades, que ahora se agrupan en sigilo, atletismo, etc. Sin embargo, trabajando el DM con los players es bastante sencillo convertir uno a otro. En el caso mas extremo, puedes tratar las diferencias entre las clases de 3.5 y las de Pathfinder como ACFs (Alternative Class Features) tales como aparecen en los suplementos del propio 3.5