En principio no se pueden combinar los ataques "naturales" y con armas. Al ganar un sistema de ataques naturales, son los únicos que tiene. Los personajes (y bichos raros) que usan ataques naturales nunca tienen más ataques.
Uséase, si el tipo tiene ataque base +7 y usa lo del mutágeno salvaje para ganar dos ataques de garra y un mordisco que según leo funcionan como ataques primarios, tendrá tres ataques: Garra +7/Garra +7/Mordisco +7.
Lo veo algo raro, normalmente las garras funcionan como ataques primarios y hay otro ataque secundario que suele ser el mordisco.
Lo que permite la dote de Ataque múltiple es reducir en 2 puntos los penalizadores a los ataques secundarios. Un troll con garra/garra/mordisco normalmente atacaría con las dos garras con +7 y el mordisco con +2. Con la dote ese +2 se convertiría en un +5 (-2 en lugar de -5).
Como se supone que los tres ataques que obtiene el alquimista con el mutágeno salvaje son primarios, no hay ataques secundarios que mejorar.
Creo que queda más o menos claro, aunque sigo viendo algo raro que los tres ataques sean primarios.